bootstrap.sh: fix permission handling of sites/default/settings.php

drush site-install can change the permissions in sites/default so use
a more robust scheme to set them when needed.

bootstrap.sh: update the installation profile setting before installing

This fixes
a Drupal\Core\Installer\Exception\InstallProfileMismatchException

bootstrap.sh: disable some overly permissive settings in settings.local.php

This avoids warnings in the status report after "drin bootstrap --devel"

bootstrap.sh: allow re-bootstrapping with a different installation profile

bootstrap.sh: remove an obsolete comment

Initial import